Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cul7Q8VE73 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cul7Q8VE73 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms