Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE47

Uba5, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba5Q8VE47 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uba5Q8VE47 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uba5Q8VE47 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms