Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCN5

Cth, Cystathionine gamma-lyase, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CthQ8VCN5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CthQ8VCN5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CthQ8VCN5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CthQ8VCN5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CthQ8VCN5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CthQ8VCN5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CthQ8VCN5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CthQ8VCN5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CthQ8VCN5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CthQ8VCN5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms