Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc12Q8R344 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms