Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms