Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MyripQ8K3I4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms