Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk5rap2Q8K389 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk5rap2Q8K389 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms