Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm1Q8K377 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms