Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncapd2Q8K2Z4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms