Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cd300eQ8K249 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cd300eQ8K249 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cd300eQ8K249 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd300eQ8K249 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cd300eQ8K249 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cd300eQ8K249 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cd300eQ8K249 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cd300eQ8K249 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cd300eQ8K249 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cd300eQ8K249 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cd300eQ8K249 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cd300eQ8K249 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cd300eQ8K249 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cd300eQ8K249 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd300eQ8K249 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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