Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms