Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gfm1Q8K0D5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfm1Q8K0D5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfm1Q8K0D5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfm1Q8K0D5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms