Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbrd1Q8K0B2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms