Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q4Q8HWB2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q4Q8HWB2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q4Q8HWB2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms