Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klre1Q8CJC7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Klre1Q8CJC7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klre1Q8CJC7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klre1Q8CJC7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klre1Q8CJC7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klre1Q8CJC7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klre1Q8CJC7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klre1Q8CJC7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klre1Q8CJC7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms