Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Znf628Q8CJ78 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms