Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbsnQ8CIT9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbsnQ8CIT9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms