Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip3Q8CHD8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rab11fip3Q8CHD8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
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