Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc34Q8CFI2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc34Q8CFI2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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