Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hpf1Q8CFE2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hpf1Q8CFE2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms