Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx8Q8CFD4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx8Q8CFD4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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