Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Usp27Q8CEG8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Usp27Q8CEG8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Usp27Q8CEG8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Usp27Q8CEG8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Usp27Q8CEG8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Usp27Q8CEG8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp27Q8CEG8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp27Q8CEG8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Usp27Q8CEG8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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