Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc178Q8CDV0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms