Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo43Q8CDI2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxo43Q8CDI2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms