Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD26

Slc35e1, Solute carrier family 35 member E1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e1Q8CD26 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Slc35e1Q8CD26 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e1Q8CD26 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e1Q8CD26 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Slc35e1Q8CD26 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e1Q8CD26 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Slc35e1Q8CD26 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc35e1Q8CD26 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc35e1Q8CD26 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc35e1Q8CD26 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e1Q8CD26 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e1Q8CD26 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc35e1Q8CD26 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e1Q8CD26 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slc35e1Q8CD26 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e1Q8CD26 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e1Q8CD26 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e1Q8CD26 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slc35e1Q8CD26 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slc35e1Q8CD26 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Slc35e1Q8CD26 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Slc35e1Q8CD26 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Slc35e1Q8CD26 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Slc35e1Q8CD26 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e1Q8CD26 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms