Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Nhlrc3Q8CCH2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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