Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps53Q8CCB4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps53Q8CCB4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps53Q8CCB4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms