Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nhsl1Q8CAF4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nhsl1Q8CAF4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nhsl1Q8CAF4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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