Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp1Q8C8U0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp1Q8C8U0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms