Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.3■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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N4bp3Q8C7U1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
N4bp3Q8C7U1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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N4bp3Q8C7U1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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N4bp3Q8C7U1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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N4bp3Q8C7U1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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N4bp3Q8C7U1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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N4bp3Q8C7U1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
N4bp3Q8C7U1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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