Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Usp20Q8C6M1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Usp20Q8C6M1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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Usp20Q8C6M1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp20Q8C6M1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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