Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssuh2Q8C3L1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms