Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnrQ8BYI9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TnrQ8BYI9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnrQ8BYI9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnrQ8BYI9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnrQ8BYI9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnrQ8BYI9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms