Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Skor1Q8BX46 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skor1Q8BX46 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skor1Q8BX46 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skor1Q8BX46 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skor1Q8BX46 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skor1Q8BX46 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skor1Q8BX46 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms