Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp38Q8BW70 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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