Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Triml1Q8BVP1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms