Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx17Q8BVL3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx17Q8BVL3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms