Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms