Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca8Q8BHX3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms