Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfnl1Q8BHW9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfnl1Q8BHW9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfnl1Q8BHW9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfnl1Q8BHW9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfnl1Q8BHW9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms