Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf41Q8BH75 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf41Q8BH75 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf41Q8BH75 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf41Q8BH75 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf41Q8BH75 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf41Q8BH75 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf41Q8BH75 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf41Q8BH75 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf41Q8BH75 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf41Q8BH75 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf41Q8BH75 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf41Q8BH75 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms