Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp4f39Q8BGU0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp4f39Q8BGU0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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