Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Vipas39Q8BGQ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Vipas39Q8BGQ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Vipas39Q8BGQ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Vipas39Q8BGQ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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