Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4bQ8BGE6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms