Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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