Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms