Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Necab1Q8BG18 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms