Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChfrQ810L3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms