Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Smim19Q80ZU4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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