Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34b3Q80ZS5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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